Футбольных команд с именем "Динамо" очень и очень много, но загребский клуб входит в число одних из известнейших, наряду с киевским или московским. Правда "Динамо" он стал не сразу. Официальной датой образования команды считается 9 июня 1945 года, месяц спустя расформирования трёх сильнейших команд города – "Граджански", ХАСК и "Конкордия". Состав "Динамо" был набран преимущественно из футболистов "Граджански", да и тренер Мартон Буковий до этого работал как раз в этой команде.
"Динамо" уже в дебютном сезоне заняло второе место в чемпионате Югославии, отстав на пять очков от первенствовавшего "Партизана". На следующий год пришел первый успех - "Динамо" выиграло золотые медали, уже на пять очков опередив преследователей, а Франьо Вольф второй раз подряд стал лучшим бомбардиром первенства. Повторить чемпионский сезон спустя год "синим" не удалось, и следующего золота пришлось ждать ещё шесть лет. Однако в 1951 году "Динамо" удалось завоевать ещё один титул – Кубок Югославии.
В пятидесятые годы загребская команда оставалась одной из сильнейших в Югославии, дважды сумев завоевать золотые медали чемпионата страны. В эти же годы "Динамо" впервые дебютировало в еврокубках. Но первый блин оказался комом – югославы проиграли чешской "Дукле". А первой победы пришлось ждать два года. В шестидесятых "Динамо" зарекомендовало себя как "кубковая" команда, шесть раз выходя в финал национального розыгрыша, причем четыре из них стали победными. В 1963-м "Динамо" дошло до финала Кубка Ярмарок, обыграв по пути "Порту", бельгийский "Юнион", мюнхенскую "Баварию" и "Ференцварош". В финале "Валенсия" выиграла оба матча.
Сезон 1966/67 стал для "Динамо" историческим, ведь именно тогда загребская команда сумела выиграть Кубок Ярмарок, победив в решающем матче английский "Лидс". В семидесятые наступил некоторый кризис в игре "Динамо", который был преодолён только в сезоне 1981/82, когда "синие" вновь сумели стать чемпионом Югославии.
После образования независимой Хорватии именно "Динамо" предстояло стать главной командой страны. "Синие" четырнадцать раз становился чемпионом Хорватии, а последние семь лет и вовсе является бессменным лидером хорватского футбола. Однако все успехи загребцев ограничены национальным уровнем. В сезоне 98/99 "Динамо" впервые попало в групповой этап Лиги Чемпионов, где заняли второе место. Но команда Велимира Заеца с рекордными для себя 8-ю очками не прошла дальше, так как из шести групп выходили только две команды, занявшие вторые места, а у МЮ и "Реала" показатели были значительно лучше. С наступлением ХХІ века команда не могла пробиться сквозь сито квалификации, уступая то "Милану", то "Вердеру", то "Арсеналу", то обоим украинским грандам. Даже когда реформы Платини создали "путь чемпионов" к ЛЧ, то и там хорваты не могли пройти "Ред Булл" (Зальцбург) и "Шериф", которому "Динамо" уступило по пенальти.
Только в сезоне 2011/12 "Динамо" удалось вернуться в Лигу чемпионов, где команда была разбита в пух и прах "Реалом", "Аяксом" и "Лионом", пропустив в общей сложности семнадцать мячей.
Загребское "Динамо" имеет одну из известнейших во всем мире фанатских группировок. Bad Blue Boys (BBB) была основана 17 марта 1986 года. Она известна своими перфомансами и невероятной поддержкой своей любимой команды. BBB издают журналы, посвящённые клубу и субкультуре ультрас. Наиболее активная часть ультрас «Динамо», в основном молодёжь, базируется на северной трибуне стадиона "Максимир", более возрастные члены BBB располагаются на восточной трибуне.